一、 实验原理

SNP检测是检测染色体基因组中单个核苷酸的突变而引起的DNA序列的多态性的技术，SNP以单个碱基的颠换、转换、插入和缺失等形式存在。作为第三代分子标记，SNP标记具有很大的发展潜力，被广泛应用于生物、农学、医学、生物进化等众多领域，在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用。

服务类型：

1.Taqman探针法(定性)

针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针，进行实时荧光PCR扩增。

2.SNaPshot法测SNP

主要是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术，主要针对中等通量的SNP分型项目。3.MassARRAy法

MassArray质谱系统是目前市场上拥有最高性价比的中高通量SNP分型检测系统，通过激光激发DNA分子片段，再用飞行时间来判断片段分子量的大小。

4.Illumina BeadXpress法

采用BeadXpress系统进行批量SNP位点检测，可以同时检测1-384个SNP位点，往往用于基因组芯片结果确认，适合高通量检测。

5.直接测序法

在所有SNP的检测方法中，对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法，也是SNP分析的金标准。

二、应用简介

SNP可导致人类疾病，如癌症、传染性疾病、自身免疫性疾病等，SNP是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据，因此被广泛用于群体遗传学研究和疾病相关基因的研究，在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。
应用领域：

1. 遗传图谱绘制的标记；

2. 疾病诊断和疾病易感基因的鉴别；

3. 药物基因组学研究和新药筛选；

4. 药物代谢和药物遗传学；

5. 法医鉴定和个体识别；

6. 群体遗传学研究和遗传多态性分析；

7. 物种鉴定、菌种鉴定等。

三、实验方法

A. 直接测序法：

a、样品基因组DNA提取；

b、根据不同的区域进行引物设计、合成；

c、对所有样品进行基因扩增并纯化；

d、测序；

e、统计与分析。

B. TaqMan探针法：

a、样品基因组DNA提取与质检；

b、探针的设计、合成；

c、预实验优化PCR反应体系；

d、荧光定量PCR按测；

e、SNP位点数据分析。

C. SNaPshot法：

a、样品基因组DNA提取与质检；

b、引物的设计、合成；

c、扩增反应；

d、延伸反应；

e、测序仪检测；

f、数据分析

四、样本送检要求

五、案例展示

Taqman探针法(定性)

SNaPshot法测SNP

六、 常见问题

①  为保证待测目的区域测序真实可靠，引物设计应该使待测目的区域边界距离上下游引物至少各50bp； 

② 引物设计建议使用在线方式，以保证成功率； 

③ 为保证测序敏感性，PCR产物片段大小应在250bp－650bp范围； 

④ 为方便实验，建议引物合成时分装成1 管，方便将PCR与测序的引物分开；

⑤ 为保证引物的特异性，建议引物设计后在NCBI上blast确认； 

⑥ 为防止降解，PCR产物应尽快测序，否则应该保存在-20℃，且时间不宜过长；

⑦ 为保证结果真实性，建议对关键点进行反向测序确认。 

七、 服务流程